Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms