Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms