Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms