Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCGF3Q3KNV8 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms