Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
ATP2B3Q16720 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2B3Q16720 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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