Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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