Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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CTF1Q16619 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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CTF1Q16619 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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CTF1Q16619 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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CTF1Q16619 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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CTF1Q16619 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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CTF1Q16619 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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CTF1Q16619 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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CTF1Q16619 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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CTF1Q16619 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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CTF1Q16619 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTF1Q16619 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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