Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CARTPTQ16568 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms