Protein–RNA interactions for Protein: Q16514

TAF12, Transcription initiation factor TFIID subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF12Q16514 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAF12Q16514 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms