Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SF1Q15637 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SF1Q15637 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SF1Q15637 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SF1Q15637 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SF1Q15637 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SF1Q15637 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SF1Q15637 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SF1Q15637 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SF1Q15637 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SF1Q15637 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SF1Q15637 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SF1Q15637 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SF1Q15637 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SF1Q15637 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SF1Q15637 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SF1Q15637 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SF1Q15637 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SF1Q15637 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SF1Q15637 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SF1Q15637 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SF1Q15637 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SF1Q15637 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SF1Q15637 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SF1Q15637 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SF1Q15637 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SF1Q15637 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SF1Q15637 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SF1Q15637 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SF1Q15637 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SF1Q15637 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SF1Q15637 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SF1Q15637 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SF1Q15637 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SF1Q15637 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SF1Q15637 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SF1Q15637 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SF1Q15637 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SF1Q15637 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SF1Q15637 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SF1Q15637 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SF1Q15637 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SF1Q15637 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SF1Q15637 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SF1Q15637 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SF1Q15637 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SF1Q15637 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SF1Q15637 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SF1Q15637 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SF1Q15637 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SF1Q15637 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SF1Q15637 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SF1Q15637 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SF1Q15637 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SF1Q15637 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SF1Q15637 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SF1Q15637 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SF1Q15637 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SF1Q15637 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SF1Q15637 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SF1Q15637 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SF1Q15637 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SF1Q15637 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SF1Q15637 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SF1Q15637 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SF1Q15637 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SF1Q15637 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SF1Q15637 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SF1Q15637 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SF1Q15637 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SF1Q15637 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SF1Q15637 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SF1Q15637 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SF1Q15637 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SF1Q15637 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SF1Q15637 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SF1Q15637 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SF1Q15637 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SF1Q15637 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SF1Q15637 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SF1Q15637 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SF1Q15637 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SF1Q15637 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SF1Q15637 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SF1Q15637 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SF1Q15637 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SF1Q15637 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SF1Q15637 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SF1Q15637 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SF1Q15637 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SF1Q15637 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SF1Q15637 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SF1Q15637 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SF1Q15637 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SF1Q15637 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SF1Q15637 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SF1Q15637 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SF1Q15637 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SF1Q15637 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SF1Q15637 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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