Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTF1Q15361 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TTF1Q15361 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TTF1Q15361 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC21.33■■□□□ 1
TTF1Q15361 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TTF1Q15361 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TTF1Q15361 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TTF1Q15361 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTF1Q15361 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TTF1Q15361 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTF1Q15361 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TTF1Q15361 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTF1Q15361 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TTF1Q15361 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TTF1Q15361 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TTF1Q15361 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TTF1Q15361 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TTF1Q15361 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
TTF1Q15361 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TTF1Q15361 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TTF1Q15361 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TTF1Q15361 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TTF1Q15361 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TTF1Q15361 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTF1Q15361 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTF1Q15361 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTF1Q15361 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTF1Q15361 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTF1Q15361 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTF1Q15361 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TTF1Q15361 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms