Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GAPVD1Q14C86 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GAPVD1Q14C86 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
GAPVD1Q14C86 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
GAPVD1Q14C86 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GAPVD1Q14C86 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GAPVD1Q14C86 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
GAPVD1Q14C86 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GAPVD1Q14C86 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
GAPVD1Q14C86 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
GAPVD1Q14C86 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GAPVD1Q14C86 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GAPVD1Q14C86 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GAPVD1Q14C86 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GAPVD1Q14C86 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GAPVD1Q14C86 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GAPVD1Q14C86 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GAPVD1Q14C86 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GAPVD1Q14C86 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GAPVD1Q14C86 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GAPVD1Q14C86 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GAPVD1Q14C86 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GAPVD1Q14C86 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
GAPVD1Q14C86 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GAPVD1Q14C86 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GAPVD1Q14C86 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GAPVD1Q14C86 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
GAPVD1Q14C86 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GAPVD1Q14C86 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GAPVD1Q14C86 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GAPVD1Q14C86 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GAPVD1Q14C86 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GAPVD1Q14C86 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GAPVD1Q14C86 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GAPVD1Q14C86 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GAPVD1Q14C86 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GAPVD1Q14C86 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GAPVD1Q14C86 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GAPVD1Q14C86 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GAPVD1Q14C86 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GAPVD1Q14C86 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GAPVD1Q14C86 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GAPVD1Q14C86 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GAPVD1Q14C86 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GAPVD1Q14C86 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GAPVD1Q14C86 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GAPVD1Q14C86 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GAPVD1Q14C86 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
GAPVD1Q14C86 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GAPVD1Q14C86 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
GAPVD1Q14C86 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GAPVD1Q14C86 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
GAPVD1Q14C86 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GAPVD1Q14C86 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GAPVD1Q14C86 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GAPVD1Q14C86 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GAPVD1Q14C86 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GAPVD1Q14C86 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GAPVD1Q14C86 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GAPVD1Q14C86 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GAPVD1Q14C86 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GAPVD1Q14C86 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GAPVD1Q14C86 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GAPVD1Q14C86 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GAPVD1Q14C86 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
GAPVD1Q14C86 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
GAPVD1Q14C86 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
GAPVD1Q14C86 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GAPVD1Q14C86 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GAPVD1Q14C86 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GAPVD1Q14C86 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GAPVD1Q14C86 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GAPVD1Q14C86 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GAPVD1Q14C86 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GAPVD1Q14C86 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GAPVD1Q14C86 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
GAPVD1Q14C86 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GAPVD1Q14C86 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
GAPVD1Q14C86 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
GAPVD1Q14C86 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GAPVD1Q14C86 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GAPVD1Q14C86 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GAPVD1Q14C86 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GAPVD1Q14C86 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GAPVD1Q14C86 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GAPVD1Q14C86 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GAPVD1Q14C86 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GAPVD1Q14C86 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GAPVD1Q14C86 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
GAPVD1Q14C86 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GAPVD1Q14C86 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GAPVD1Q14C86 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
GAPVD1Q14C86 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
GAPVD1Q14C86 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GAPVD1Q14C86 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
GAPVD1Q14C86 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
GAPVD1Q14C86 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
GAPVD1Q14C86 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GAPVD1Q14C86 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GAPVD1Q14C86 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
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