Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
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