Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIN2CQ14957 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIN2CQ14957 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
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