Protein–RNA interactions for Protein: Q14657

LAGE3, EKC/KEOPS complex subunit LAGE3, humanhuman

Predictions only

Length 143 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAGE3Q14657 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LAGE3Q14657 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms