Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BECN1Q14457 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms