Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
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COL9A3Q14050 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
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