Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LAMB3Q13751 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms