Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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TUBA3CQ13748 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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TUBA3CQ13748 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
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TUBA3CQ13748 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
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TUBA3CQ13748 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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