Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
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