Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms