Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
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SKP2Q13309 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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SKP2Q13309 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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