Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCGB2A2Q13296 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms