Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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NR1H3Q13133 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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NR1H3Q13133 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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NR1H3Q13133 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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NR1H3Q13133 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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NR1H3Q13133 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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NR1H3Q13133 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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NR1H3Q13133 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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NR1H3Q13133 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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