Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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