Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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