Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC10A2Q12908 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms