Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms