Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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