Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFEMP1Q12805 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms