Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

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Length 1,436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NUP160Q12769 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NUP160Q12769 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NUP160Q12769 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NUP160Q12769 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NUP160Q12769 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NUP160Q12769 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NUP160Q12769 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
NUP160Q12769 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NUP160Q12769 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NUP160Q12769 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NUP160Q12769 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NUP160Q12769 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUP160Q12769 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
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