Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms