Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms