Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GOLGA3Q08378 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GOLGA3Q08378 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GOLGA3Q08378 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GOLGA3Q08378 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GOLGA3Q08378 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GOLGA3Q08378 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GOLGA3Q08378 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GOLGA3Q08378 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GOLGA3Q08378 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GOLGA3Q08378 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GOLGA3Q08378 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GOLGA3Q08378 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GOLGA3Q08378 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GOLGA3Q08378 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GOLGA3Q08378 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
GOLGA3Q08378 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GOLGA3Q08378 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GOLGA3Q08378 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GOLGA3Q08378 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GOLGA3Q08378 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GOLGA3Q08378 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GOLGA3Q08378 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GOLGA3Q08378 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GOLGA3Q08378 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GOLGA3Q08378 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GOLGA3Q08378 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GOLGA3Q08378 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
GOLGA3Q08378 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GOLGA3Q08378 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GOLGA3Q08378 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GOLGA3Q08378 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GOLGA3Q08378 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GOLGA3Q08378 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GOLGA3Q08378 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms