Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms