Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNDQ07001 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms