Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXOSC9Q06265 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms