Protein–RNA interactions for Protein: Q06141

REG3A, Regenerating islet-derived protein 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG3AQ06141 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC12.17□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC12.16□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
REG3AQ06141 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms