Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EMX2Q04743 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms