Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ID3Q02535 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ID3Q02535 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ID3Q02535 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ID3Q02535 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ID3Q02535 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ID3Q02535 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ID3Q02535 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ID3Q02535 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ID3Q02535 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ID3Q02535 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ID3Q02535 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ID3Q02535 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ID3Q02535 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ID3Q02535 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ID3Q02535 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ID3Q02535 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ID3Q02535 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ID3Q02535 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ID3Q02535 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ID3Q02535 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ID3Q02535 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ID3Q02535 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ID3Q02535 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ID3Q02535 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ID3Q02535 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ID3Q02535 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ID3Q02535 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ID3Q02535 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ID3Q02535 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ID3Q02535 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ID3Q02535 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ID3Q02535 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ID3Q02535 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ID3Q02535 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ID3Q02535 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ID3Q02535 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ID3Q02535 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ID3Q02535 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ID3Q02535 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ID3Q02535 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ID3Q02535 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ID3Q02535 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ID3Q02535 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ID3Q02535 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ID3Q02535 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ID3Q02535 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ID3Q02535 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ID3Q02535 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ID3Q02535 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ID3Q02535 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ID3Q02535 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ID3Q02535 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ID3Q02535 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ID3Q02535 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ID3Q02535 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ID3Q02535 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ID3Q02535 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ID3Q02535 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ID3Q02535 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ID3Q02535 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ID3Q02535 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ID3Q02535 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ID3Q02535 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ID3Q02535 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ID3Q02535 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ID3Q02535 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ID3Q02535 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ID3Q02535 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ID3Q02535 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ID3Q02535 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ID3Q02535 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ID3Q02535 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ID3Q02535 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ID3Q02535 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ID3Q02535 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ID3Q02535 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ID3Q02535 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ID3Q02535 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ID3Q02535 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
ID3Q02535 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ID3Q02535 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
ID3Q02535 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
ID3Q02535 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ID3Q02535 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ID3Q02535 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ID3Q02535 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ID3Q02535 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ID3Q02535 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ID3Q02535 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ID3Q02535 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ID3Q02535 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
ID3Q02535 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ID3Q02535 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ID3Q02535 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ID3Q02535 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
ID3Q02535 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ID3Q02535 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ID3Q02535 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ID3Q02535 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms