Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC6A3Q01959 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms