Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
XPCQ01831 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
XPCQ01831 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
XPCQ01831 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
XPCQ01831 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
XPCQ01831 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
XPCQ01831 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
XPCQ01831 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
XPCQ01831 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
XPCQ01831 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
XPCQ01831 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
XPCQ01831 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
XPCQ01831 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
XPCQ01831 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
XPCQ01831 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XPCQ01831 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XPCQ01831 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
XPCQ01831 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XPCQ01831 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XPCQ01831 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XPCQ01831 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XPCQ01831 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XPCQ01831 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XPCQ01831 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XPCQ01831 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XPCQ01831 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XPCQ01831 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XPCQ01831 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XPCQ01831 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XPCQ01831 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XPCQ01831 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XPCQ01831 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XPCQ01831 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XPCQ01831 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XPCQ01831 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
XPCQ01831 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XPCQ01831 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XPCQ01831 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
XPCQ01831 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XPCQ01831 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
XPCQ01831 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XPCQ01831 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XPCQ01831 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
XPCQ01831 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XPCQ01831 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XPCQ01831 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XPCQ01831 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XPCQ01831 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XPCQ01831 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
XPCQ01831 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
XPCQ01831 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
XPCQ01831 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
XPCQ01831 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XPCQ01831 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XPCQ01831 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
XPCQ01831 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XPCQ01831 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XPCQ01831 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
XPCQ01831 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XPCQ01831 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XPCQ01831 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XPCQ01831 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
XPCQ01831 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XPCQ01831 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
XPCQ01831 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
XPCQ01831 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
XPCQ01831 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
XPCQ01831 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
XPCQ01831 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
XPCQ01831 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
XPCQ01831 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
XPCQ01831 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XPCQ01831 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XPCQ01831 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XPCQ01831 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XPCQ01831 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
XPCQ01831 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XPCQ01831 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
XPCQ01831 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC24■■□□□ 1.43
XPCQ01831 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
XPCQ01831 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
XPCQ01831 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
XPCQ01831 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XPCQ01831 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XPCQ01831 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XPCQ01831 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
XPCQ01831 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
XPCQ01831 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
XPCQ01831 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC24■■□□□ 1.43
XPCQ01831 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC24■■□□□ 1.43
XPCQ01831 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC24■■□□□ 1.43
XPCQ01831 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
XPCQ01831 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
XPCQ01831 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XPCQ01831 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
XPCQ01831 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XPCQ01831 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XPCQ01831 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
XPCQ01831 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XPCQ01831 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms