Protein–RNA interactions for Protein: Q00888

PSG4, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG4Q00888 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSG4Q00888 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms