Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK6Q00534 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms