Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms