Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms