Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNAP25P60880 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms