Protein–RNA interactions for Protein: P59665

DEFA1, Neutrophil defensin 1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA1P59665 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA1P59665 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA1P59665 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA1P59665 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA1P59665 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA1P59665 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA1P59665 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA1P59665 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA1P59665 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA1P59665 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA1P59665 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA1P59665 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA1P59665 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA1P59665 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA1P59665 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA1P59665 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA1P59665 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA1P59665 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA1P59665 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA1P59665 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA1P59665 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA1P59665 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA1P59665 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms