Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIK1P57059 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIK1P57059 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIK1P57059 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIK1P57059 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIK1P57059 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIK1P57059 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIK1P57059 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIK1P57059 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIK1P57059 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIK1P57059 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIK1P57059 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIK1P57059 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIK1P57059 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIK1P57059 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SIK1P57059 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIK1P57059 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIK1P57059 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIK1P57059 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIK1P57059 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIK1P57059 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIK1P57059 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIK1P57059 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIK1P57059 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIK1P57059 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIK1P57059 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SIK1P57059 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIK1P57059 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIK1P57059 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIK1P57059 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIK1P57059 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIK1P57059 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIK1P57059 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SIK1P57059 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SIK1P57059 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIK1P57059 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIK1P57059 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIK1P57059 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIK1P57059 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIK1P57059 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIK1P57059 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIK1P57059 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIK1P57059 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIK1P57059 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIK1P57059 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SIK1P57059 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIK1P57059 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIK1P57059 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIK1P57059 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIK1P57059 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIK1P57059 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIK1P57059 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIK1P57059 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIK1P57059 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIK1P57059 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIK1P57059 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SIK1P57059 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIK1P57059 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIK1P57059 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIK1P57059 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIK1P57059 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIK1P57059 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIK1P57059 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIK1P57059 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIK1P57059 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIK1P57059 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIK1P57059 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIK1P57059 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIK1P57059 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIK1P57059 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SIK1P57059 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIK1P57059 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIK1P57059 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIK1P57059 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SIK1P57059 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SIK1P57059 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIK1P57059 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SIK1P57059 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIK1P57059 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIK1P57059 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIK1P57059 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIK1P57059 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIK1P57059 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIK1P57059 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIK1P57059 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIK1P57059 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIK1P57059 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIK1P57059 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIK1P57059 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIK1P57059 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIK1P57059 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIK1P57059 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIK1P57059 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIK1P57059 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SIK1P57059 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIK1P57059 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIK1P57059 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIK1P57059 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SIK1P57059 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIK1P57059 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms