Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME5P56597 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NME5P56597 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME5P56597 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME5P56597 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME5P56597 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME5P56597 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME5P56597 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME5P56597 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME5P56597 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME5P56597 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME5P56597 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME5P56597 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME5P56597 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME5P56597 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME5P56597 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME5P56597 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME5P56597 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME5P56597 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME5P56597 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME5P56597 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME5P56597 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME5P56597 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME5P56597 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME5P56597 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME5P56597 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME5P56597 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME5P56597 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME5P56597 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME5P56597 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME5P56597 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME5P56597 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME5P56597 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME5P56597 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME5P56597 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NME5P56597 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME5P56597 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME5P56597 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME5P56597 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME5P56597 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME5P56597 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME5P56597 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME5P56597 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME5P56597 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME5P56597 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME5P56597 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME5P56597 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME5P56597 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME5P56597 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME5P56597 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME5P56597 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME5P56597 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME5P56597 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME5P56597 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME5P56597 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME5P56597 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME5P56597 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME5P56597 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME5P56597 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME5P56597 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME5P56597 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME5P56597 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME5P56597 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME5P56597 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME5P56597 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME5P56597 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NME5P56597 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME5P56597 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME5P56597 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME5P56597 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME5P56597 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME5P56597 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME5P56597 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME5P56597 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME5P56597 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME5P56597 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME5P56597 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME5P56597 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME5P56597 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME5P56597 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME5P56597 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NME5P56597 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NME5P56597 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NME5P56597 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NME5P56597 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NME5P56597 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME5P56597 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME5P56597 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME5P56597 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME5P56597 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME5P56597 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME5P56597 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME5P56597 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME5P56597 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NME5P56597 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME5P56597 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME5P56597 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME5P56597 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME5P56597 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME5P56597 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms